Dis @Stephane_Delplanque tu nous en racontes un peu plus sur VegLab ? au moins les grandes lignes ? 
Bien sûr, mais tu connais déjà le début Florent 
VegLab est une plateforme web dédiée au traitement et à l’analyse de données pour les végétations et les habitats naturels. Grosso modo, la plateforme permet de regrouper les outils utiles aux phytosociologues, écologues, etc. qui souhaitent traiter de la données phytosocio.
Avec entre autre :
- module type tableur
- bases de données (données et référentiels)
- serveur R
- espaces de discussions
- cartographie
A mon sens, il y a toujours plusieurs difficultés pour traiter de la donnée phytosocio actuellement. En dehors de l’accès aux données elles-mêmes, les opérations d’harmonisation, de correspondances entre référentiels et les outils qui ne sont pas faits pour communiquer entre eux sont un vrai frein. On voit bien le temps « perdu » entre les référentiels, excel, R, Juice, etc. sans compter quand il faut gérer la mise à jour des outils, des référentiels en question… Bref VegLab propose de se focaliser sur ce qui compte : le traitement des données et leur partage.
Un rapide historique :
- projet lancé en 2016-2017 au sein de Tela Botanica avec la réalisation d’un prototype et première phase des travaux engagée.
- 2019-2022 : je continu le développement sur mon temps libre (c’est à dire pas beaucoup)
- 2023 : soutien du CBNSA
- 2025 : soutien d’autres CBN
En place aujourd’hui :
- Les bases de données
- Référentiels : l’application peut fonctionner avec tout type de référentiel flore/phyto/habitat. Pour l’instant et pour la France Taxref/Catveg visés mais j’ai déjà pu faire des tests avec d’autres référentiels et données (coucou la République Tchèque).
- L’interface principale de construction de tableaux (simples, synthétiques, fusion, agrégation de taxons, etc.)
- Gestion des identifications (relevés, SyE, tableaux)
- Partage des tableaux (avec des notions de tableaux dérivés === copies de travail)
- Un serveur R permettant de jouer des analyses statistiques en direct (ex: clustering)
- Des indicateurs stats en train d’être mis en place (calcul de similarité récemment)
- Des espaces de discussion
- etc.
Les métiers visés : phytosociologues évidemment mais aussi écologues, BE, chercheurs…
Emprise géographique : France principalement mais l’appli est faite pour fonctionner en Europe de l’ouest.
Après y avoir travaillé près de 10 ans, c’est un projet ambitieux dont je n’avais pas mesuré l’effort nécessaire en m’y attaquant.
J’espère pouvoir ouvrir la plateforme à partir de l’année prochaine de manière progressive. Je n’ai pas de date à communiquer tant les contraintes sont encore nombreuses (temps, ressources).
A l’occasion, j’essaierai de faire une vidéo dans l’hiver. Ce sera plus parlant qu’en texte.
Stéphane.
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Tu vas héberger ça où ? Ça fait quelle taille environ ?
Sur 2 serveurs dédiés chez OVH. J’en ai déjà un pour l’instant.
La taille : quelques centaines de Go… Si l’idée est de l’héberger ici, je ne pense pas que ce soit envisageable malheureusement.
ah oui ! quelques centaines de Go quand même ! xD
oui, effectivement, si ça avait été moins gourmand je te l’aurai proposé, mais là…
à moins qu’on réfléchisse à une autre solution d’hébergement partagée.
moi j’ai juste créé ce forum dans l’urgence avant la date fatidique du 31 octobre (jamais halloween ne m’avait paru si terrifiant !)